自学考试专业的课程设置分为：
1、公共基础课：所有专业或者同类专业应考者都必须参加的课程。如《马克思主义基本原理概论》、《中国近代史纲要》、《英语（二）》、《政治经济学》等。公共课虽然不一定同所学专业有直接联系，但它是培养德、智、体发展人才，为进一步学习其他内容提供方法论不可少的课程。
2、专业基础课：该专业考生要学习的基础理论、基本知识和基本技能的课程。基础课是为了应考者掌握专业的知识，学习专业的科学技术，发展我们有关能力打下基础。像工商企业管理（本）专业中的《管理学原理》和电子商务专业的《电子商务基础与应用》这类的，就属于基础课了。
3、专业课：同专业知识、技能直接联系的基本课程（简称专业课）。
4、选修课：有限制的选择自己需要的科目进行学习。选修科目的选择是有限制的，只能在专业考试计划规定的课程内选择。简单说就是给我们一些选修科目，自己挑着学。考生根据自己的能力和兴趣选择想考的科目。
5、实践性环节。
公共基础课、专业基础课、专业课三类课程的学分比例大致为3：4：3或2：5：3 [13]
按照专业考试计划的要求，每门课程进行一次性考试。课程考试合格者，发给单科合格证书，并按规定计算学分，不及格者，可参加下一次该科目的考试。专科（基础科）一般为3—4年，本科一般为4—5年。