假如用于在仓库货架长进行货物碓码，要选择耐久性强、不易变形、静载量大的木托盘。这样的托盘一般是四面方向进叉、田字结构的双面托盘。
假如用于频繁地运输、搬运和装卸工作，要选择刚性强、硬度强、动载量较大的木托盘。这样的托盘一般是两面或四面方向进叉、日字或川字结构的单面托盘。
首先，存放木托盘的厂房要应保持干净卫生，而且要随时注意通风，这样有利于木托盘存放在干燥的环境下，防止腐烂。
其次，易燃品、易爆品或违禁品严禁带入仓库，在仓库的外侧要有明确的标志，而且还要有专门的人员进行检查。这尤其需要注意，因为木托盘是木材原料，而且干燥，记忆点燃导致火灾发生。造成大量的财产损失和人员伤亡。
物料管理科对所经管的成品库存及仓运设备应负责使用之责，如果破损要及时汇报，并进行相应的维护修理。因为木托盘往往承载的是一些货物或急需、或贵重，对物料管理好，保护好货运。
木托盘包装箱处理方法主要是热处理。木材的中 心温度应达到56℃，并保持至少30分钟。木材应在封闭的地方用熏蒸至少16小时。然后在防盗和通风的地方降低熏蒸剂的浓度。