CRCC实行总监责任制，设有综合业务部、机车事业部、基础设施事业部、城市轨道设备事业部、投诉监理部等5个专业部门和相应的后勤保障部门。

质检部以铁道部产品质量监督检验中心为基础，主要包括质检业务管理室和机车车辆检验站、铁道建筑检验站、通信信号检验站、金属化学检验站、接触网零部件检验站、运输包装检验站、卫生检验站等7个检验站。

认证部亦以铁道部产品质量监督检验中心为基础，主要包括业务部、标准协调部、检查检验部、检验协调部和申诉监理部。

中铁铁路产品认证中心--铁道部产品质量监督检验中心的职能和职责是组织并参与铁道行业相关的国家标准和行业标准的制、修订及企业标准审查备案。