工程保证金的弊端：
1、保证金存在被挪用的风险，
2、保证金收取及退还的手续繁琐，退还不及时，使资金效率降低，
3、资金占用量大，且容易造成这些资金的无效沉淀。
信贷影响：担保公司在开具保函时不会影响投保企业的银行授信额度，但由于本身规模和实力的限制普遍会设置严格的反担保措施，往往要求债务人以其自有资产、银行存款、有价证券或通过其他担保人等提交反担保，作为担保人出具担保的条件。
保函中必须明确规定为交易双方的哪一项交易提供扣保。在交易双方的义务是根据双方签订的合同确定的情况下，保函应列明合同号、合同签订日期、签约双方的名称等。
保函是指银行、保险公司、担保公司或担保人应申请人的请求，向受益人开立的一种书面信用担保凭证，以书面形式出具的、凭提交与承诺条件相符的书面索款通知和其它类似单据即行付款的保证文件。